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Lima, D. F. C. (2018). Unraveling the evolutionary history of livestock dog breeds. Mémoire de master, Universidade do Porto · PDF · 2,5 Mo
Cette étude est particulièrement précieuse parce qu'elle n'a pas été conçue pour étudier le PLE. Son objet est l'histoire évolutive des chiens de garde et de conduite de troupeaux ; le Spanish Wolfdog n'est qu'une des quinze races ibériques analysées. Qu'une équipe portugaise, avec d'autres marqueurs et sans aucun intérêt dans la cause du lobero, situe le PLE exactement là où le situent les études espagnoles constitue une validation croisée indépendante : ce que la science peut offrir de plus solide.
Il convient d'en préciser la portée : l'analyse génomique à haute densité (plus de 170 000 SNP) n'a été appliquée qu'aux 24 races de garde eurasiatiques. Le Perro Lobo Español, en tant que chien de conduite, a été analysé avec les 43 microsatellites autosomiques, aux côtés des autres races ibériques. Les données du PLE dans cette étude proviennent donc des microsatellites, non de la puce SNP.
Le bloc ibérique analysé avec les microsatellites réunit quinze races de garde et de conduite, portugaises et espagnoles : Cão de Castro Laboreiro, Serra da Estrela, Cão de Gado Transmontano, Rafeiro do Alentejo, Mastín Español, Mastín del Pirineo, Montaña del Pirineo, Cão da Serra de Aires, Barbado da Terceira, Cão de Fila de São Miguel, Cão de Água Português, Pastor Vasco, Carea Leonés, Can de Palleiro et le Spanish Wolfdog —le Perro Lobo Español—.
Un point souvent mal interprété mérite d'être souligné : cette étude n'inclut ni le Berger Allemand ni le Chien-loup tchécoslovaque. Son cadre de comparaison est entièrement celui des chiens de travail ibériques et eurasiatiques. Elle n'apporte donc —et ne prétend pas apporter— aucune comparaison directe du PLE avec ces deux races. Cette comparaison est celle qu'offrent les études de Doadrio (2014) et de Villegas (2017–2019).
C'est le résultat le plus frappant du travail. Dans l'analyse bayésienne STRUCTURE, une partie des sujets Carea Leonés ne se regroupe pas avec les autres chiens de leur propre race, mais dans le même cluster que le Perro Lobo Español. Un fond génétique partagé entre chiens de travail du nord-ouest de la péninsule, détecté par une équipe qui ne le cherchait pas.
Avec 43 microsatellites, le PLE présente une hétérozygotie attendue de 0,67 (observée 0,63), dans la fourchette moyenne-haute des chiens de conduite ibériques analysés, dont l'éventail va de 0,63 (Cão da Serra de Aires) à 0,69 (Carea Leonés). Ce sont des valeurs propres à une population établie et diverse : aucune trace de l'appauvrissement génétique qui trahit les races de création récente.
Les races modernes et reconstruites montrent une diversité moindre et des clusters fermés. Les populations fonctionnelles ibériques —dont le PLE— montrent des gradients, des recouvrements historiques et une forte variabilité. Ce sont des réalités distinctes qui exigent des cadres d'analyse distincts.
L'honnêteté quant aux limites de la preuve est ce qui la rend crédible. Dans ce travail, le Perro Lobo Español est représenté par treize sujets : un échantillon réduit, suffisant pour situer la population sur la carte génétique ibérique, mais insuffisant pour décrire en détail sa structure interne. Les valeurs d'hétérozygotie, en outre, ne sont pas directement comparables à celles de Doadrio (2014) ou de Villegas (2019), car les panels de marqueurs diffèrent —43 microsatellites ici contre les 18 du panel ISAG— et chaque panel produit ses propres chiffres.
Ce que cette étude établit bel et bien, et ce n'est pas rien, c'est que le PLE se comporte comme une population ibérique parmi d'autres, apparentée aux chiens de travail de son territoire, sans signes de création récente. Rien de plus, et rien de moins.
Le mémoire pose explicitement que les populations canines ibériques ne peuvent s'interpréter avec le modèle centre-européen de la race. L'isolement du PLE est fonctionnel et géographique, non esthétique. Le flux génique historique a existé, mais dans un cadre régional cohérent.
Cela légitime scientifiquement le PLE comme population autochtone, non comme «race artificielle» ni comme dérivé du Berger Allemand. Le problème n'est pas que le PLE n'entre pas dans le modèle FCI : c'est que ce modèle n'a pas été conçu pour des réalités comme la sienne.
ÉTUDE 03 · LIMA 2018
Le PLE s'inscrit dans le continuum ibérique et partage un cluster avec une partie du Carea Leonés.
Trois équipes différentes, trois panels de marqueurs différents, aucun intérêt partagé — et un même résultat. Le Perro Lobo Español est une population fonctionnelle ancienne, génétiquement diverse, différenciée des races lupoïdes modernes et intégrée naturellement au système ibérique des chiens rustiques. Quand des études qui n'ont pas été conçues pour concorder concordent, cela porte en science un nom : convergence des preuves.