الدراسة 03 · جامعة بورتو · 2018

أطروحة Lima
جامعة بورتو

الوثيقة الأصلية

Lima, D. F. C. (2018). Unraveling the evolutionary history of livestock dog breeds. رسالة ماجستير، جامعة بورتو · PDF · 2.5 ميغابايت

⬇ تنزيل PDF
بطاقة الدراسة

التأكيد المستقل
من البرتغال

المؤلّفDiogo Filipe Coutinho Lima
المشرفةRaquel Godinho (CIBIO-InBio / جامعة بورتو)
المشرفان المشاركانIgnacio Doadrio (CSIC) وPedro Silva (CIBIO-InBio)
المؤسسةكلية العلوم، جامعة بورتو (FCUP) — CIBIO-InBio
السنة2018
النوعرسالة ماجستير — Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução
المحور الرئيسيالتاريخ التطوّري لكلاب حراسة الماشية ورعيها (إيبيريا وأوراسيا)
المؤشّرات (الـ PLE هنا)43 قمراً صناعياً دقيقاً جسمياً و6 من الصبغي Y — 294 كلباً من 15 سلالة إيبيرية
المؤشّرات (كلاب الحراسة فقط)شريحة Illumina CanineHD، أكثر من 170٬000 SNP — 24 سلالة حراسة أوراسية
عينات PLE13 فرداً (Spanish Wolfdog)
التحليلاتالتنوّع الجيني، STRUCTURE، شبكات النماذج الفردانية، المسافات الجينية (FST)

تنفرد هذه الدراسة بقيمتها لأنها لم تُصمَّم لدراسة الـ PLE. فموضوعها هو التاريخ التطوّري لكلاب حراسة الماشية ورعيها؛ وما الـ Spanish Wolfdog إلا واحدة من خمس عشرة سلالة إيبيرية جرى تحليلها. وأن يضع فريق برتغالي، بمؤشّرات مختلفة ودون أي مصلحة في قضية الـ lobero، الـ PLE في الموضع نفسه الذي تضعه فيه الدراسات الإسبانية، فذلك تحقّقٌ متقاطع مستقل: وهو أمتن ما يمكن أن يقدّمه العلم.

ويجدر تحديد النطاق: طُبِّق التحليل الجينومي عالي الكثافة (أكثر من 170٬000 SNP) على سلالات الحراسة الأوراسية الأربع والعشرين فقط. أما الـ Perro Lobo Español، بوصفه كلب رعي، فقد حُلِّل بالأقمار الصناعية الدقيقة الجسمية الثلاثة والأربعين، إلى جانب سائر السلالات الإيبيرية. ومن ثمّ فإنّ بيانات الـ PLE في هذه الدراسة مصدرها الأقمار الصناعية الدقيقة، لا شريحة SNP.

السلالات المحلَّلة

تضمّ الكتلة الإيبيرية المحلَّلة بالأقمار الصناعية الدقيقة خمس عشرة سلالة حراسة ورعي، برتغالية وإسبانية: Cão de Castro Laboreiro، Serra da Estrela، Cão de Gado Transmontano، Rafeiro do Alentejo، Mastín Español، Mastín del Pirineo، Montaña del Pirineo، Cão da Serra de Aires، Barbado da Terceira، Cão de Fila de São Miguel، Cão de Água Português، Pastor Vasco، Carea Leonés، Can de Palleiro، إضافةً إلى الـ Spanish Wolfdog — أي الـ Perro Lobo Español.

ثمّة نقطة كثيراً ما أُسيء فهمها، وتستحق التأكيد: لا تشمل هذه الدراسة الراعي الألماني ولا الذئب التشيكوسلوفاكي. فإطار المقارنة فيها هو بالكامل كلاب العمل الإيبيرية والأوراسية. ولذلك فهي لا تقدّم — ولا تدّعي أن تقدّم — أي مقارنة مباشرة بين الـ PLE وهاتين السلالتين. تلك المقارنة تقدّمها دراستا Doadrio (2014) وVillegas (2017–2019).

النتائج الأساسية

الـ PLE وCarea Leonés في العنقود نفسه

هذا ألفت ما توصّل إليه العمل. ففي تحليل STRUCTURE البايزي، لا يتجمّع جزء من أفراد Carea Leonés مع بقية كلاب سلالته، بل في العنقود نفسه مع الـ Perro Lobo Español. خلفية جينية مشتركة بين كلاب العمل في شمال غرب شبه الجزيرة، اكتشفها فريق لم يكن يبحث عنها.

تنوّع طبيعي، دون عنق زجاجة

بثلاثة وأربعين قمراً صناعياً دقيقاً، يُظهر الـ PLE تغايراً زيجياً متوقَّعاً قدره 0.67 (والملاحَظ 0.63)، في النطاق المتوسط-المرتفع بين كلاب الرعي الإيبيرية المحلَّلة، الذي يمتدّ من 0.63 (Cão da Serra de Aires) إلى 0.69 (Carea Leonés). وهي قيم تخصّ مجموعة راسخة ومتنوّعة: لا أثر فيها للإفقار الجيني الذي يفضح السلالات حديثة النشأة.

النموذج الإيبيري في مقابل النموذج الأوروبي الأوسط

تُظهر السلالات الحديثة والمُعاد بناؤها تنوّعاً أقلّ وعناقيد مغلقة. أما المجموعات الوظيفية الإيبيرية — ومنها الـ PLE — فتُظهر تدرّجات وتداخلات تاريخية وتبايناً عالياً. إنها وقائع مختلفة تستلزم أُطر تحليل مختلفة.

ما لا تتيح هذه الدراسة تأكيده

إنّ الصدق بشأن حدود الدليل هو ما يجعله جديراً بالثقة. ففي هذا العمل يمثّل الـ Perro Lobo Español ثلاثة عشر فرداً: عيّنة صغيرة، تكفي لوضع المجموعة على الخريطة الجينية الإيبيرية، لكنها لا تكفي لوصف بنيتها الداخلية بالتفصيل. كما أنّ قيم التغاير الزيجي ليست قابلة للمقارنة المباشرة بقيم Doadrio (2014) أو Villegas (2019)، لأنّ لوحات المؤشّرات مختلفة —43 قمراً صناعياً دقيقاً هنا مقابل 18 في لوحة ISAG— وكل لوحة تنتج أرقامها الخاصة.

أما ما تُثبته هذه الدراسة فعلاً، وليس بالقليل، فهو أنّ الـ PLE يسلك سلوك مجموعة إيبيرية أخرى، على صلة قرابة بكلاب العمل في إقليمه، دون أي إشارة إلى نشأة حديثة. لا أكثر، ولا أقل.

أهمّ إسهام مفاهيمي

تطرح الأطروحة صراحةً أنّ مجموعات الكلاب الإيبيرية لا يمكن تأويلها بالنموذج الأوروبي الأوسط للسلالة. فعزلة الـ PLE وظيفية وجغرافية، لا جمالية. وقد وُجد تدفّق جيني تاريخي، لكن ضمن إطار إقليمي متماسك.

وهذا يمنح الـ PLE مشروعية علمية بوصفه مجموعة محلية، لا «سلالة اصطناعية» ولا مشتقّاً من الراعي الألماني. فالمشكلة ليست أنّ الـ PLE لا يندرج في نموذج FCI: بل أنّ ذلك النموذج لم يُصمَّم لوقائع كواقع الـ PLE.

الدراسات الثلاث: تحقّق متقاطع

الدراسة 01 · DOADRIO 2014

ينفصل الـ PLE عن الراعي الألماني.

الدراسة 02 · VILLEGAS 2019

يتمتّع الـ PLE بتنوّع جيني عالٍ ويشكّل عنقوداً إيبيرياً خاصاً به.

الدراسة 03 · LIMA 2018

ينتمي الـ PLE إلى المتّصل الإيبيري ويتشارك عنقوداً مع جزء من Carea Leonés.

ثلاثة فرق مختلفة، وثلاث لوحات مؤشّرات مختلفة، ولا مصلحة مشتركة — ونتيجة واحدة بعينها. إنّ الـ Perro Lobo Español مجموعة وظيفية قديمة، متنوّعة جينياً، متمايزة عن السلالات الذئبية الحديثة، ومندمجة اندماجاً طبيعياً في المنظومة الإيبيرية للكلاب الريفية. وحين تتوافق دراساتٌ لم تُصمَّم لتتوافق، فلذلك في العلم اسم: تقارُب الأدلّة.