原資料
Lima, D. F. C. (2018). Unraveling the evolutionary history of livestock dog breeds. 修士論文、ポルト大学 · PDF · 2.5 MB
この研究がとりわけ貴重なのは、PLE を研究するために設計されたものではないからです。主題は家畜の護衛犬・牧畜犬の進化史であり、Spanish Wolfdog は分析された15のイベリア犬種のひとつにすぎません。異なるマーカーを用い、lobero の大義に何の利害ももたないポルトガルの研究チームが、スペインの諸研究とまったく同じ位置に PLE を置く——これは独立した相互検証であり、科学が示しうる最も確かなものです。
範囲を正確にしておきます。高密度のゲノム解析(17万超の SNP)は、ユーラシアの護衛犬24犬種にのみ適用されました。Perro Lobo Español は牧畜犬として、他のイベリア犬種とともに、43の常染色体マイクロサテライトで解析されています。したがって本研究における PLE のデータは、SNP チップではなくマイクロサテライトに由来します。
マイクロサテライトで分析されたイベリアの一群は、ポルトガルとスペインの護衛犬・牧畜犬15犬種から成ります:Cão de Castro Laboreiro、Serra da Estrela、Cão de Gado Transmontano、Rafeiro do Alentejo、Mastín Español、Mastín del Pirineo、Montaña del Pirineo、Cão da Serra de Aires、Barbado da Terceira、Cão de Fila de São Miguel、Cão de Água Português、Pastor Vasco、Carea Leonés、Can de Palleiro、そして Spanish Wolfdog——Perro Lobo Español です。
しばしば誤解されてきた点を強調しておきます。本研究にはジャーマン・シェパードもチェコスロバキアン・ウルフドッグも含まれていません。その比較の枠組みは、まったくもってイベリアおよびユーラシアの使役犬です。したがって、PLE とこの二犬種との直接の比較は提供しませんし、提供しようともしていません。その比較は Doadrio(2014)と Villegas(2017–2019)の研究が示すものです。
本研究で最も目を引く発見です。ベイズ法による STRUCTURE 解析において、Carea Leonés の一部の個体は、自らの犬種の他の犬とではなく、Perro Lobo Español と同じクラスターにまとまりました。半島北西部の使役犬に共有される遺伝的背景が、それを探していなかったチームによって検出されたのです。
43マイクロサテライトによれば、PLE の期待ヘテロ接合度は 0.67(観測値0.63)で、分析されたイベリアの牧畜犬の中〜高域にあたります(範囲は 0.63 の Cão da Serra de Aires から 0.69 の Carea Leonés まで)。確立した多様な集団に固有の値であり、新しく作出された犬種を露呈させる遺伝的貧困の痕跡はありません。
近代の犬種や再構成された犬種は、多様性が低く閉じたクラスターを示します。イベリアの機能的集団——PLE を含む——は、勾配、歴史的な重なり、高い変異性を示します。これは別々の実相であり、別々の分析枠組みを要します。
証拠の限界について正直であることこそが、その信頼性を支えます。本研究において Perro Lobo Español を代表するのは13頭です。小さな標本であり、この集団をイベリアの遺伝地図上に位置づけるには足りても、その内部構造を細かく記述するには足りません。さらにヘテロ接合度の値は、Doadrio(2014)や Villegas(2019)のものと直接には比較できません。マーカーのパネルが異なり——ここでは43マイクロサテライト、ISAG パネルでは18——パネルごとに固有の数値が出るからです。
本研究が確かに示したこと——それは決して小さくありません——は、PLE がイベリアの一集団としてふるまい、その土地の使役犬と近縁であり、新しく作出された形跡がない、ということです。それ以上でも、それ以下でもありません。
本論文は、イベリアのイヌ集団を中欧型の犬種モデルで解釈することはできない、と明言します。PLE の隔離は機能的・地理的なものであって、美的なものではありません。歴史的な遺伝子流動は存在しましたが、それは首尾一貫した地域的枠組みの内側でのことでした。
これは PLE を在来集団として学術的に正当づけるものであり、「人工の犬種」でもジャーマン・シェパードの派生でもないことを意味します。問題は PLE が FCI のモデルに収まらないことではありません。そのモデルが、PLE のような実相のために設計されていないことなのです。
研究 03 · LIMA 2018
PLE はイベリアの連続体に収まり、Carea Leonés の一部と同じクラスターを共有する。
三つの異なるチーム、三つの異なるマーカー・パネル、共有された利害はなし——そして同一の結果。Perro Lobo Español は古い機能的集団であり、遺伝的に多様で、現代の狼型犬種とは異なり、イベリアの素朴な犬の体系に自然に組み込まれています。一致するように設計されていない研究どうしが一致するとき、科学ではそれに名があります。証拠の収斂です。