Estudio 03 · Universidad de Oporto · 2018

Tesis Lima
Universidad de Oporto

Documento original

Lima, D. F. C. (2018). Unraveling the evolutionary history of livestock dog breeds. Tesis de máster, Universidade do Porto · PDF · 2.5 MB

⬇ Descargar PDF
Ficha del estudio

La confirmación independiente
desde Portugal

AutorDiogo Filipe Coutinho Lima
DirectoraRaquel Godinho (CIBIO-InBio / Universidade do Porto)
Co-directoresIgnacio Doadrio (CSIC) y Pedro Silva (CIBIO-InBio)
InstituciónFaculdade de Ciências, Universidade do Porto (FCUP) — CIBIO-InBio
Año2018
TipoTesis de máster — Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução
Enfoque principalHistoria evolutiva de los perros de guarda y pastoreo de ganado (Iberia y Eurasia)
Marcadores (el PLE está aquí)43 microsatélites autosómicos y 6 del cromosoma Y — 294 perros de 15 razas ibéricas
Marcadores (solo perros de guarda)Chip Illumina CanineHD, más de 170.000 SNPs — 24 razas de guarda eurasiáticas
Muestras PLE13 ejemplares (Spanish Wolfdog)
AnálisisDiversidad genética, STRUCTURE, redes de haplotipos, distancias genéticas (FST)

Este estudio es particularmente valioso porque no fue diseñado para estudiar el PLE. Su objeto es la historia evolutiva de los perros de guarda y pastoreo de ganado; el Spanish Wolfdog es una más de las quince razas ibéricas analizadas. Que un equipo portugués, con marcadores distintos y sin ningún interés en la causa del lobero, sitúe al PLE exactamente donde lo sitúan los estudios españoles es validación cruzada independiente: lo más sólido que puede ofrecer la ciencia.

Conviene precisar el alcance: el análisis genómico de alta densidad (más de 170.000 SNPs) se aplicó únicamente a las 24 razas de guarda eurasiáticas. El Perro Lobo Español, como perro de pastoreo, se analizó con los 43 microsatélites autosómicos, junto a las demás razas ibéricas. Los datos del PLE en este estudio proceden, por tanto, de los microsatélites, no del chip de SNPs.

Razas analizadas

El bloque ibérico analizado con microsatélites reúne quince razas de guarda y de pastoreo, portuguesas y españolas: Cão de Castro Laboreiro, Serra da Estrela, Cão de Gado Transmontano, Rafeiro do Alentejo, Mastín Español, Mastín del Pirineo, Montaña del Pirineo, Cão da Serra de Aires, Barbado da Terceira, Cão de Fila de São Miguel, Cão de Água Português, Pastor Vasco, Carea Leonés, Can de Palleiro y el Spanish Wolfdog —el Perro Lobo Español—.

Es importante subrayar un punto que se ha malinterpretado con frecuencia: este estudio no incluye al Pastor Alemán ni al Lobo Checoslovaco. Su marco de comparación es enteramente el de los perros de trabajo ibéricos y eurasiáticos. Por tanto, no aporta —ni pretende aportar— ninguna comparación directa del PLE con esas dos razas. Esa comparación es la que ofrecen los estudios de Doadrio (2014) y Villegas (2017–2019).

Resultados clave

El PLE y el Carea Leonés, en el mismo clúster

Es el hallazgo más llamativo del trabajo. En el análisis bayesiano STRUCTURE, una parte de los ejemplares de Carea Leonés no se agrupa con los demás perros de su propia raza, sino en el mismo clúster que el Perro Lobo Español. Un fondo genético compartido entre perros de trabajo del noroeste peninsular, detectado por un equipo que no buscaba encontrarlo.

Diversidad normal, sin cuello de botella

Con 43 microsatélites, el PLE presenta una heterocigosidad esperada de 0,67 (observada 0,63), en la franja media-alta de los perros de pastoreo ibéricos analizados, cuyo rango va de 0,63 (Cão da Serra de Aires) a 0,69 (Carea Leonés). Son valores propios de una población establecida y diversa: no hay rastro del empobrecimiento genético que delata a las razas de creación reciente.

Modelo ibérico frente a modelo centroeuropeo

Las razas modernas y reconstruidas muestran menor diversidad y clústeres cerrados. Las poblaciones funcionales ibéricas — incluyendo el PLE — muestran gradientes, solapamientos históricos y alta variabilidad. Son realidades distintas que requieren marcos de análisis distintos.

Lo que este estudio no permite afirmar

La honestidad sobre los límites de la evidencia es lo que la hace creíble. En este trabajo, el Perro Lobo Español está representado por trece ejemplares: una muestra pequeña, suficiente para situar a la población en el mapa genético ibérico, pero insuficiente para describir su estructura interna con detalle. Los valores de heterocigosidad, además, no son directamente comparables con los de Doadrio (2014) o Villegas (2019), porque los paneles de marcadores son distintos —43 microsatélites aquí frente a los 18 del panel ISAG— y cada panel produce sus propias cifras.

Lo que este estudio sí acredita, y no es poco, es que el PLE se comporta como una población ibérica más, emparentada con los perros de trabajo de su territorio, sin señales de creación reciente. Nada más, y nada menos.

La aportación conceptual más relevante

La tesis plantea explícitamente que las poblaciones caninas ibéricas no pueden interpretarse con el modelo centroeuropeo de raza. El aislamiento del PLE es funcional y geográfico, no estético. El flujo génico histórico existió, pero dentro de un marco regional coherente.

Esto legitima científicamente al PLE como población autóctona, no como «raza artificial» ni como derivado del Pastor Alemán. El problema no es que el PLE no encaje en el modelo FCI: es que ese modelo no fue diseñado para realidades como la del PLE.

Los tres estudios: validación cruzada

ESTUDIO 01 · DOADRIO 2014

El PLE se separa del Pastor Alemán.

ESTUDIO 02 · VILLEGAS 2019

El PLE tiene alta diversidad genética y forma un clúster ibérico propio.

ESTUDIO 03 · LIMA 2018

El PLE encaja en el continuum ibérico y comparte clúster con parte del Carea Leonés.

Tres equipos distintos, tres paneles de marcadores distintos, ningún interés compartido — y un mismo resultado. El Perro Lobo Español es una población funcional antigua, genéticamente diversa, diferenciada de las razas lupoides modernas e integrada de forma natural en el sistema ibérico de perros rústicos. Cuando estudios que no fueron diseñados para coincidir coinciden, eso en ciencia tiene un nombre: convergencia de evidencia.